油红O（Oil Red O）是一种脂溶性偶氮染料，是很强的脂溶剂和染脂剂，能特异性地使组织和细胞内中性甘油三脂、脂质以及脂蛋白等染色。当组织切片置入染液时，染料则离开染液而溶于组织内的脂质（如脂滴）中，使组织内的脂滴呈红色。用于分析细胞样品中脂质状况。

次甲基蓝（化学式：C₁₆H₁₈ClN₃S，分子量：319.86），3,7-双（二甲氨基）吩噻嗪-5-鎓氯化物，是一种吩噻嗪盐，正电荷不稳定。外观为深绿色青铜光泽结晶（三水合物），熔点215ºC，闪点14℃，密度1g/mL。可溶于水/乙醇，不溶于醚类。亚甲基蓝在空气中较稳定，其水溶液呈碱性，有毒。

二甲苯青FF，一种核酸电泳的示踪染料，可与溴酚蓝按照一定比例配制成loadingbuffer用于琼脂糖和聚丙烯酰胺电泳。

丽春红S 猩红S可以用于PVDF膜、硝酸纤维素膜（nitrocellulose membrane）和醋酸纤维素膜（cellulose acetate membrane）上的蛋白的检测。

詹纳斯绿可专一性地对线粒体进行活体染色，这是由于线粒体内的细胞色素氧化酶系的作用，使染料始终保持氧化状态(即有色状态)，呈蓝绿色。