碘化丙啶（Propidium Iodide，PI）是一种常用的细胞核荧光染料，作为一种溴化乙锭（EB）的类似物，能够嵌入碱基之间实现与DNA结合。这种结合没有或者几乎无序列倾向性，大约每4-5个DNA碱基对结合一个染料。PI也能与RNA结合，需要用核酸酶处理来区分DNA和RNA染色。

罗丹明 123是一种常用的阳离子绿色荧光染料，可以透过细胞膜从而在活细胞线粒体内聚集，并发出黄绿色荧光，可广泛用于检测线粒体膜电位，并且对细胞没有任何毒性，另外，Rh12与常规蛋白染料 PE-Cy5 和AMCA(7-amino-4-methyl coumarin-3-acetic acid)等没有荧光干 扰，因此可用于多标实验。

磺酰罗丹明B是一种高度水溶性，非固定的红色荧光极性示踪剂，用于细胞形态调查、荧光脂质体制备、细胞-细胞间通信研究和接下来的吞噬体-溶酶体摄取和融合。

台盼蓝 生物染色剂，如病毒检验，注入循环系统可使肾小管着色，哺乳动物、低等脊椎动物和昆虫的各种组织活体染色。

线粒体膜电位检测试剂盒(JC-1)是一种以 JC-1为荧光探针，快速灵敏地检测细胞、组织或纯化的线粒体膜电位变化的试剂盒，可以用于早期的细胞凋亡检测，也是用来检测细胞早期凋亡的常用方法。